针对河网地区，从流域尺度探索氮磷等生源要素和有机污染物迁移转化机理，揭示了生源要素的陆域非点源污染规律，提出了有机污染物多环芳烃和多氯联苯土壤生物降解机理，确定了环境可接受的有机污染物土壤生物降解终点；通过河网区不同水动力条件下污染物输移过程及环境效应研究，揭示了不同水动力系统中污染物迁移转化规律、污染物通量交换、环境行为及生态效应；构建了流域水资源保护理论与技术体系，提出了“水安全、水环境、水景观、水文化、水经济”五位一体的城市水生态系统建设模式；研发了满足防洪、输水、净污、生态功能要求的城市河湖水质改善与生态调控技术。发表论文63篇，其中SCI & Ei检索论文29篇，出版专著1部。研究成果“不同水动力条件下污染物输移过程及系统耦合模型研究”获2007年国家自然科学奖二等奖，“城市水生态系统建设与生态修复理论技术及应用”获2005年国家科技进步奖二等奖，“水功能区划与水资源保护理论技术及应用”获2004年国家科技进步奖二等奖；获国家发明专利授权3项。